（一）《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請(qǐng)書》審核以下方面：
1.申請(qǐng)書封面為法定代表人簽名、加蓋企業(yè)公章。
2.主要情況表中，“基礎(chǔ)研究投入費(fèi)用總額”該指標(biāo)一般企業(yè)不會(huì)涉及，應(yīng)填0，如填報(bào)不為0的，應(yīng)和企業(yè)再次確認(rèn)；“申請(qǐng)認(rèn)定前一年內(nèi)是否發(fā)生過重大安全、質(zhì)量事故，嚴(yán)重環(huán)境違法”看選項(xiàng)是否誤選“是”，應(yīng)選“否”。
3.查驗(yàn)知識(shí)產(chǎn)權(quán)原件，按照知識(shí)產(chǎn)權(quán)匯總表順序逐一核對(duì)，重點(diǎn)核對(duì)“授權(quán)日期”“授權(quán)號(hào)”“獲得方式”是否與原件一致。
（二）查驗(yàn)企業(yè)依法成立的《營(yíng)業(yè)執(zhí)照》等相關(guān)注冊(cè)登記證件的復(fù)印件，對(duì)比原件內(nèi)容是否完全一致。
（三）知識(shí)產(chǎn)權(quán)證明材料
1.查驗(yàn)知識(shí)產(chǎn)權(quán)是否完整（包括證書、權(quán)利要求項(xiàng)、摘要），與原件是否一致。
2.知識(shí)產(chǎn)權(quán)為受讓、受贈(zèng)或并購(gòu)方式的，查驗(yàn)申報(bào)材料中知識(shí)產(chǎn)權(quán)的權(quán)利所屬人是否已變更，并附相關(guān)證明材料。
3.知識(shí)產(chǎn)權(quán)的專利權(quán)人為多方共有的，查驗(yàn)是否有共有方不以此知識(shí)產(chǎn)權(quán)申報(bào)高企的聲明或證明材料。
（四）近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開發(fā)費(fèi)用專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告、近一個(gè)會(huì)計(jì)年度高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入專項(xiàng)審計(jì)或鑒證報(bào)告，檢查以下方面：
1.檢查專項(xiàng)審計(jì)或鑒證報(bào)告是否完整，并帶防偽標(biāo)識(shí)。
2.查驗(yàn)出具報(bào)告的中介機(jī)構(gòu)是否在推薦名單里。未在推薦名單里的應(yīng)附上符合資質(zhì)的證明材料；如中介機(jī)構(gòu)已經(jīng)是明確沒有資質(zhì)的，申報(bào)材料無效，應(yīng)予退回。
3.以上專項(xiàng)審計(jì)或鑒證報(bào)告必須為原件，均按會(huì)計(jì)年度分開出具。
（五）近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)報(bào)告，檢查中介機(jī)構(gòu)審計(jì)/鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)報(bào)告是否完整（包括主表、附注、財(cái)務(wù)說明書）。
（六）企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表，檢查以下方面：
1.近三個(gè)會(huì)計(jì)年度企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表是否完整。
2.期間費(fèi)用表中的“管理費(fèi)用”下-“研究費(fèi)用”的數(shù)據(jù)一般不能為0。
3.稅表不能出現(xiàn)手寫、涂改的痕跡，如確實(shí)為稅務(wù)局專管人員修改，則在修改處加蓋稅務(wù)局公章。
（七）對(duì)涉密企業(yè)，須提醒企業(yè)將申請(qǐng)認(rèn)定高新技術(shù)企業(yè)的申報(bào)材料做脫密處理，確保涉密信息安全。